MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 112124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
2	NC_019951	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
3	NC_019951	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
4	NC_019951	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
5	NC_019951	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
6	NC_019951	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
7	NC_019951	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
8	NC_019951	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	433629071
9	NC_019951	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
10	NC_019951	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
11	NC_019951	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
12	NC_019951	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629071
13	NC_019951	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	433629071
14	NC_019951	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
15	NC_019951	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	433629071
16	NC_019951	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	433629071
17	NC_019951	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	433629071
18	NC_019951	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629071
19	NC_019951	GACGTG	2	12	790	801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433629071
20	NC_019951	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
21	NC_019951	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629071
22	NC_019951	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629071
23	NC_019951	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	433629071
24	NC_019951	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	433629071
25	NC_019951	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
26	NC_019951	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
27	NC_019951	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
28	NC_019951	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
29	NC_019951	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	433629071
30	NC_019951	TGATC	2	10	1200	1209	20 %	40 %	20 %	20 %	433629071
31	NC_019951	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629071
32	NC_019951	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
33	NC_019951	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	433629071
34	NC_019951	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
35	NC_019951	TCT	2	6	1532	1537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019951	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019951	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019951	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019951	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019951	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019951	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019951	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019951	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019951	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019951	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019951	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019951	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019951	CG	3	6	1963	1968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019951	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	433629072
50	NC_019951	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	433629072
51	NC_019951	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	433629072
52	NC_019951	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433629072
53	NC_019951	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
54	NC_019951	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
55	NC_019951	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
56	NC_019951	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
57	NC_019951	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
58	NC_019951	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433629072
59	NC_019951	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	433629072
60	NC_019951	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
61	NC_019951	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
62	NC_019951	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629072
63	NC_019951	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629072
64	NC_019951	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
65	NC_019951	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
66	NC_019951	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	433629072
67	NC_019951	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
68	NC_019951	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629072
69	NC_019951	ACCG	2	8	2846	2853	25 %	0 %	25 %	50 %	433629072
70	NC_019951	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	433629072
71	NC_019951	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629072
72	NC_019951	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	433629072
73	NC_019951	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629072
74	NC_019951	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	433629072
75	NC_019951	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
76	NC_019951	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	433629072
77	NC_019951	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	433629073
78	NC_019951	GGTA	2	8	3466	3473	25 %	25 %	50 %	0 %	433629073
79	NC_019951	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
80	NC_019951	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
81	NC_019951	CGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
82	NC_019951	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629073
83	NC_019951	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
84	NC_019951	GGTT	2	8	3648	3655	0 %	50 %	50 %	0 %	433629073
85	NC_019951	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
86	NC_019951	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629073
87	NC_019951	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
88	NC_019951	CCGC	2	8	3876	3883	0 %	0 %	25 %	75 %	433629073
89	NC_019951	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629073
90	NC_019951	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
91	NC_019951	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
92	NC_019951	CGA	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
93	NC_019951	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	433629073
94	NC_019951	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
95	NC_019951	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
96	NC_019951	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
97	NC_019951	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
98	NC_019951	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
99	NC_019951	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
100	NC_019951	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
101	NC_019951	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
102	NC_019951	TGC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629074
103	NC_019951	CG	5	10	4543	4552	0 %	0 %	50 %	50 %	433629074
104	NC_019951	CGTTG	2	10	4584	4593	0 %	40 %	40 %	20 %	433629074
105	NC_019951	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
106	NC_019951	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629074
107	NC_019951	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629074
108	NC_019951	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
109	NC_019951	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629074
110	NC_019951	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629074
111	NC_019951	CG	3	6	4979	4984	0 %	0 %	50 %	50 %	433629074
112	NC_019951	GC	3	6	5022	5027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019951	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019951	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019951	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019951	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019951	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
118	NC_019951	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
119	NC_019951	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
120	NC_019951	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
121	NC_019951	CCAC	2	8	5500	5507	25 %	0 %	0 %	75 %	433629075
122	NC_019951	ACCG	2	8	5519	5526	25 %	0 %	25 %	50 %	433629075
123	NC_019951	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
124	NC_019951	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
125	NC_019951	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
126	NC_019951	CGGCGT	2	12	5603	5614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433629075
127	NC_019951	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
128	NC_019951	CAAG	2	8	5714	5721	50 %	0 %	25 %	25 %	433629075
129	NC_019951	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
130	NC_019951	CGCC	2	8	5810	5817	0 %	0 %	25 %	75 %	433629075
131	NC_019951	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629075
132	NC_019951	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
133	NC_019951	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
134	NC_019951	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
135	NC_019951	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
136	NC_019951	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
137	NC_019951	GC	3	6	6205	6210	0 %	0 %	50 %	50 %	433629075
138	NC_019951	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
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142	NC_019951	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
143	NC_019951	CGGC	2	8	6625	6632	0 %	0 %	50 %	50 %	433629075
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150	NC_019951	CCG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629075
151	NC_019951	CTG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
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255	NC_019951	TCC	2	6	10895	10900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_019951	GGC	2	6	10970	10975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_019951	GTC	2	6	10977	10982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_019951	CCT	2	6	11031	11036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_019951	GGA	2	6	11127	11132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_019951	CCG	2	6	11371	11376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_019951	TCA	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_019951	GCG	2	6	11509	11514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_019951	TCT	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_019951	TCG	2	6	11557	11562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_019951	GGT	2	6	11580	11585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019951	CGA	2	6	11627	11632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_019951	CATA	2	8	11636	11643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_019951	GCC	2	6	11714	11719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_019951	GCG	2	6	11765	11770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_019951	CGACT	2	10	11848	11857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
275	NC_019951	GGTG	2	8	11872	11879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
276	NC_019951	GT	3	6	11918	11923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
277	NC_019951	GTTGG	2	10	11979	11988	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
278	NC_019951	TGG	2	6	12006	12011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_019951	CATGC	2	10	12089	12098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_019951	CA	3	6	12108	12113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_019951	CGC	2	6	12122	12127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_019951	GGT	2	6	12128	12133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019951	GGC	2	6	12134	12139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_019951	ATC	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_019951	CAG	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_019951	GCA	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_019951	GCC	2	6	12276	12281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_019951	CG	3	6	12399	12404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_019951	GACA	2	8	12561	12568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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391	NC_019951	CTT	2	6	16905	16910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629082
392	NC_019951	CCT	2	6	16950	16955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433629082
393	NC_019951	GAT	2	6	16966	16971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629082
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395	NC_019951	GTTCGA	2	12	17025	17036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433629082
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496	NC_019951	CCAA	2	8	20684	20691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_019951	CGCC	2	8	20696	20703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_019951	TACG	2	8	20727	20734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_019951	CG	3	6	20736	20741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_019951	CG	3	6	20828	20833	0 %	0 %	50 %	50 %	433629087

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